Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

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Length 625 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm6322-201ENSMUST00000118789 1004 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm13668-201ENSMUST00000119237 1001 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm14235-201ENSMUST00000142445 366 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm5529-201ENSMUST00000165691 891 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm5210-201ENSMUST00000182150 1010 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm8492-201ENSMUST00000182375 987 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 AC154461.3-201ENSMUST00000224831 573 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Eny2-204ENSMUST00000226827 558 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm5805-201ENSMUST00000072779 456 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm16380-201ENSMUST00000077997 478 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Tceanc-202ENSMUST00000112188 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Trmt12-201ENSMUST00000036937 4454 ntAPPRIS P1 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Vwa7-202ENSMUST00000172499 3970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Esco1-201ENSMUST00000025142 4433 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Clp1-201ENSMUST00000028475 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Rad1-202ENSMUST00000100775 4085 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm17745-201ENSMUST00000212186 1692 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Nlrp6-201ENSMUST00000106045 3823 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Lrba-202ENSMUST00000192145 8843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Med13l-201ENSMUST00000100816 9296 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm28042-203ENSMUST00000156805 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Eif3a-201ENSMUST00000025955 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Tmod2-201ENSMUST00000064433 9884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Prg4-201ENSMUST00000006171 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Tmem19-201ENSMUST00000092170 3012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Cpt1c-201ENSMUST00000063761 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Cyb5r3-202ENSMUST00000162178 2547 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Tro-202ENSMUST00000087258 6559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Slc45a4-202ENSMUST00000076224 4240 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 BC034090-201ENSMUST00000035914 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Flad1-204ENSMUST00000129308 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm45234-201ENSMUST00000129411 4359 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Tom1l2-206ENSMUST00000102683 4999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Myo7a-201ENSMUST00000084979 6849 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Ighv10-3-201ENSMUST00000103495 377 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm25053-201ENSMUST00000103982 133 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm25922-201ENSMUST00000104281 130 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm14497-201ENSMUST00000119537 580 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 4930507D10Rik-201ENSMUST00000137411 1152 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Traf3ip1Q149C2 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm38210-201ENSMUST00000191944 809 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm9116-201ENSMUST00000192400 1018 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
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Traf3ip1Q149C2 Fut2-201ENSMUST00000069800 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Traf3ip1Q149C2 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Cfap53-201ENSMUST00000114895 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Traf3ip1Q149C2 Sh2d5-201ENSMUST00000105823 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Entpd8-201ENSMUST00000044078 2299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
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Traf3ip1Q149C2 Gm31108-201ENSMUST00000204101 1633 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Slc46a2-201ENSMUST00000030081 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Ccdc136-207ENSMUST00000154619 3356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Ccndbp1-202ENSMUST00000099488 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm43334-201ENSMUST00000197740 1318 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Traf3ip1Q149C2 Armc9-201ENSMUST00000027434 5127 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Traf3ip1Q149C2 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm12795-201ENSMUST00000117594 539 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Traf3ip1Q149C2 Gm11380-201ENSMUST00000118067 560 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 91.4 ms