Protein–RNA interactions for Protein: P35822

Ptprk, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase kappa, mousemouse

Predictions only

Length 1,457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprkP35822 3110001I22Rik-201ENSMUST00000035426 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
PtprkP35822 Rbbp5-201ENSMUST00000027700 3385 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Syt12-201ENSMUST00000059295 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 n-R5s154-201ENSMUST00000122513 108 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Gm45591-201ENSMUST00000129058 843 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 6820431F20Rik-201ENSMUST00000150051 936 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Gm28893-201ENSMUST00000190951 1108 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Gm4430-202ENSMUST00000193902 1041 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 AC123061.1-201ENSMUST00000228021 999 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Gm8615-201ENSMUST00000025307 771 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Gm25483-201ENSMUST00000083224 227 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Rnft2-202ENSMUST00000121369 4431 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Egr2-201ENSMUST00000048289 2965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Prl8a1-202ENSMUST00000095926 1682 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Gm26586-201ENSMUST00000181918 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Edrf1-202ENSMUST00000128901 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Gm32914-201ENSMUST00000203815 2228 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Gk5-202ENSMUST00000122383 4455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Prkcd-201ENSMUST00000022521 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Lipe-208ENSMUST00000206861 3171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Lpin3-204ENSMUST00000109457 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Nudt15-201ENSMUST00000043813 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 6030458C11Rik-201ENSMUST00000057256 3966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Dmrta1-201ENSMUST00000052478 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Gucy2e-202ENSMUST00000108664 4415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Ninl-201ENSMUST00000109896 5093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Mrps33-202ENSMUST00000114797 500 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Gm14021-201ENSMUST00000117683 961 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Pfn4-202ENSMUST00000178879 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Gm26532-201ENSMUST00000180630 690 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Gm26611-201ENSMUST00000181449 785 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Olfr464-205ENSMUST00000217112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Dcstamp-201ENSMUST00000022913 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Phc1-204ENSMUST00000159252 3744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Acsbg1-201ENSMUST00000034822 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Galnt4-201ENSMUST00000161240 5089 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Nrf1-208ENSMUST00000115208 2492 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Armcx1-202ENSMUST00000051256 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Ercc2-201ENSMUST00000062831 3578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Stx7-205ENSMUST00000220041 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Gm45663-201ENSMUST00000210429 1632 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Cd14-201ENSMUST00000061829 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Gm28453-201ENSMUST00000185556 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Gm22582-201ENSMUST00000102283 94 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Gm24470-201ENSMUST00000104486 132 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Gm24066-201ENSMUST00000104515 131 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Gm12744-201ENSMUST00000146976 519 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Actb-207ENSMUST00000167721 1242 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Olfr414-201ENSMUST00000053178 955 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Tas2r135-201ENSMUST00000070178 1093 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Sun1-205ENSMUST00000110883 3714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Jaml-201ENSMUST00000050020 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Spag16-202ENSMUST00000113940 3559 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Cyth1-203ENSMUST00000106302 3119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Slc35b3-201ENSMUST00000021870 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Mink1-203ENSMUST00000079244 4829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Sqle-202ENSMUST00000100640 2636 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Arid3a-202ENSMUST00000105376 4892 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Zfp866-202ENSMUST00000137573 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Mark3-208ENSMUST00000221753 2394 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Rab38-201ENSMUST00000107256 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Pin1-201ENSMUST00000034689 3843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Galntl5-202ENSMUST00000114965 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Traf3ip2-201ENSMUST00000019987 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Gm7790-201ENSMUST00000118716 1310 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Filip1l-202ENSMUST00000159414 3253 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Znrf1-203ENSMUST00000168428 4451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Ighv5-12-201ENSMUST00000103450 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Ighv1-12-201ENSMUST00000103500 294 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PtprkP35822 Ifna6-201ENSMUST00000105146 570 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 7585.6 ms