Protein–RNA interactions for Protein: Q99MX1

Usp26, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 26, mousemouse

Predictions only

Length 835 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp26Q99MX1 Tbcd-201ENSMUST00000103013 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Drd1-202ENSMUST00000221470 3576 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm18210-201ENSMUST00000209001 1524 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Supt3-201ENSMUST00000050630 1508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 AC090962.2-201ENSMUST00000225064 1801 ntBASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Fam149a-201ENSMUST00000093526 5469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Hbs1l-209ENSMUST00000219915 2733 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Brcc3-203ENSMUST00000118428 2093 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Myo18a-211ENSMUST00000130627 6202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.46□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Cyb561d1-203ENSMUST00000106655 4275 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Wdr31-202ENSMUST00000107452 1437 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Mest-210ENSMUST00000157040 2383 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Clec10a-209ENSMUST00000178945 2332 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Camkv-204ENSMUST00000194206 2827 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Timm21-201ENSMUST00000025547 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Sema3f-201ENSMUST00000080560 3395 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gramd1b-201ENSMUST00000045682 7488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Fn1-213ENSMUST00000188674 7680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Fn1-217ENSMUST00000190780 7694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm2721-201ENSMUST00000222380 1571 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Cul5-201ENSMUST00000034529 3585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm11979-201ENSMUST00000119629 743 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Syngr4-202ENSMUST00000120299 722 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Uckl1os-207ENSMUST00000152365 442 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm3250-201ENSMUST00000167358 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm3238-201ENSMUST00000168298 693 ntAPPRIS P1 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm20392-201ENSMUST00000173047 701 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm28032-201ENSMUST00000184104 96 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 4930599A14Rik-201ENSMUST00000186724 387 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Prm2-202ENSMUST00000189593 674 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 9430092D12Rik-201ENSMUST00000194937 1274 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm43400-201ENSMUST00000197294 1254 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm44753-202ENSMUST00000208297 562 ntTSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Mbnl2-204ENSMUST00000227012 2390 ntBASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Xkr5-201ENSMUST00000055503 3176 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Slx4ip-201ENSMUST00000028737 2556 ntTSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Slc12a9-201ENSMUST00000039991 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.45□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gsg1-203ENSMUST00000111910 1384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Pigh-203ENSMUST00000217998 2868 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 AC174797.1-201ENSMUST00000224339 1649 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Fntb-201ENSMUST00000041008 2613 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Spred2-201ENSMUST00000093298 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Arhgap33-201ENSMUST00000044338 4280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Uspl1-201ENSMUST00000050472 3757 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm5608-201ENSMUST00000210253 2290 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Trim35-201ENSMUST00000022623 3678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Golga4-201ENSMUST00000084820 7583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Ddx17-201ENSMUST00000054014 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Slc40a1-201ENSMUST00000027137 3370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Ccl19-ps1-201ENSMUST00000119621 327 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm12136-201ENSMUST00000120460 1209 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm12712-201ENSMUST00000120676 801 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm22764-201ENSMUST00000158370 92 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm13278-201ENSMUST00000177771 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm13275-201ENSMUST00000178347 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm13277-201ENSMUST00000178480 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm13279-201ENSMUST00000178602 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm13289-201ENSMUST00000179158 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm13276-201ENSMUST00000179372 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm13287-201ENSMUST00000179490 549 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm28258-201ENSMUST00000189033 587 ntTSL 3 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm6855-201ENSMUST00000206307 790 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Zmiz1os1-202ENSMUST00000225188 1223 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Spata4-201ENSMUST00000033917 1057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Olfr963-201ENSMUST00000073433 936 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Parvg-201ENSMUST00000023074 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Polr1e-203ENSMUST00000107814 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Kdm5b-201ENSMUST00000047714 8714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Frg2f1-201ENSMUST00000079611 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Ambra1-204ENSMUST00000111316 5063 ntTSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Ank3-205ENSMUST00000092433 5072 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Ces2f-203ENSMUST00000212926 1430 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Atp6v0e2-202ENSMUST00000203011 1612 ntTSL 2 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 St6galnac6-201ENSMUST00000072111 2277 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Nmnat1-203ENSMUST00000119921 2657 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Igtp-201ENSMUST00000035266 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Kcnk10-201ENSMUST00000110113 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Gm37542-201ENSMUST00000192563 2832 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Srpk3-201ENSMUST00000002081 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Dlk1-201ENSMUST00000056110 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Wif1-203ENSMUST00000175867 2183 ntTSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Jak3-203ENSMUST00000110013 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Ttll10-206ENSMUST00000184348 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 6030458C11Rik-204ENSMUST00000228177 3156 ntBASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Vcpip1-201ENSMUST00000057438 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Usp26Q99MX1 Hsd17b13-202ENSMUST00000112803 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms