Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 506 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Morf4l2-201ENSMUST00000033797 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap24-203ENSMUST00000094559 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Bcl9-201ENSMUST00000046521 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm42449-201ENSMUST00000200349 2258 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Ifih1-201ENSMUST00000028259 5470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 1700030K09Rik-202ENSMUST00000121902 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Bace1-202ENSMUST00000078111 4041 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Rnf121-203ENSMUST00000106953 2545 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Srrm4-202ENSMUST00000139425 2798 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Aldh1a3-201ENSMUST00000015278 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm12218-201ENSMUST00000117666 399 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 BC026585-202ENSMUST00000119891 1125 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Armc2-208ENSMUST00000162405 1135 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gramd1b-212ENSMUST00000165104 3824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 4930562C15Rik-202ENSMUST00000171105 1299 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Mir99ahg-209ENSMUST00000182820 835 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm8502-201ENSMUST00000185708 901 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm21147-201ENSMUST00000186046 913 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm8510-201ENSMUST00000189202 895 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm2316-201ENSMUST00000190613 921 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Pmvk-204ENSMUST00000198440 978 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 4930478P22Rik-202ENSMUST00000201921 723 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Spata33-205ENSMUST00000212523 486 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 AC159890.1-201ENSMUST00000215382 684 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm9111-201ENSMUST00000219394 709 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Amtn-201ENSMUST00000073363 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm21811-201ENSMUST00000096485 930 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Crcp-201ENSMUST00000026608 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Katnal2-208ENSMUST00000137498 1824 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Bloc1s5-201ENSMUST00000035899 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Edaradd-201ENSMUST00000179308 6668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 AC122881.1-201ENSMUST00000225757 2695 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Chp1-202ENSMUST00000119172 3027 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Pck2-201ENSMUST00000048781 3400 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Pcdha6-201ENSMUST00000193389 4653 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Rtn3-204ENSMUST00000088171 4973 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Invs-201ENSMUST00000030029 5633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Hipk2-204ENSMUST00000160360 3907 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Abcf1-201ENSMUST00000043757 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gpc4-201ENSMUST00000033450 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Ccdc167-203ENSMUST00000129091 2256 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Ephx1-201ENSMUST00000036928 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Ypel4-201ENSMUST00000090729 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Plekha7-207ENSMUST00000182511 4502 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 8430408G22Rik-202ENSMUST00000178241 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Ucp3-202ENSMUST00000107059 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Rbm3-202ENSMUST00000115615 1183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Rbm3-203ENSMUST00000115616 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Rab15-202ENSMUST00000118604 778 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 G630018N14Rik-201ENSMUST00000135656 1231 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm15412-201ENSMUST00000137193 1096 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 1700021J08Rik-201ENSMUST00000138729 575 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gzmc-201ENSMUST00000015585 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm9639-201ENSMUST00000172205 678 ntAPPRIS P1 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm19705-203ENSMUST00000181491 678 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Bloc1s2-ps-201ENSMUST00000183232 432 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 1700013M08Rik-202ENSMUST00000200080 798 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm4482-201ENSMUST00000200876 742 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gm34973-201ENSMUST00000217087 572 ntTSL 3 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Crip3-201ENSMUST00000024764 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Cox6a2-201ENSMUST00000033049 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Mllt3-201ENSMUST00000078090 6069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Aplp2-202ENSMUST00000079758 3504 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Pygl-201ENSMUST00000071250 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Slc7a3-203ENSMUST00000113710 2750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Phf8-211ENSMUST00000168501 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Mta1-202ENSMUST00000069690 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Cln3-204ENSMUST00000116269 2487 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Cnr2-202ENSMUST00000097843 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gtf2ird1-204ENSMUST00000100652 3693 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Armcx2-202ENSMUST00000113193 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 D2hgdh-201ENSMUST00000097633 3232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Fam228a-201ENSMUST00000111154 3004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
Ubxn4Q8VCH8 Dclk3-201ENSMUST00000111879 3005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.48□□□□□ -0.41
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