Protein–RNA interactions for Protein: Q6DFW4

Nop58, Nucleolar protein 58, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop58Q6DFW4 Ankrd2-201ENSMUST00000026172 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Pemt-201ENSMUST00000000310 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Pvalb-201ENSMUST00000005860 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Isoc2b-201ENSMUST00000064547 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Gm11555-201ENSMUST00000073126 492 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Arhgap45-202ENSMUST00000099501 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Pdlim5-204ENSMUST00000168967 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Xirp1-201ENSMUST00000111635 5839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Phf20-ps-201ENSMUST00000185066 2886 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Copb1-201ENSMUST00000033012 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Pdp2-201ENSMUST00000059588 5692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Clip1-204ENSMUST00000111564 5609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Ubap2l-215ENSMUST00000198322 3385 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Cd2bp2-202ENSMUST00000166791 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Dram2-202ENSMUST00000067630 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Cckar-202ENSMUST00000200691 3230 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Ptpre-208ENSMUST00000211788 2331 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Fyn-207ENSMUST00000146287 2135 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Eif3d-201ENSMUST00000100484 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Ung-203ENSMUST00000112275 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Ncoa2-201ENSMUST00000006037 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Rps6ka6-204ENSMUST00000113428 4135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Pcdha4-201ENSMUST00000192295 4129 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Bcas1os1-201ENSMUST00000133586 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Fxyd4-203ENSMUST00000203082 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Gm45224-201ENSMUST00000208203 414 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 AC130829.1-201ENSMUST00000221548 494 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 AC164437.3-201ENSMUST00000228323 347 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 CT025533.2-201ENSMUST00000228715 1248 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Gm9823-201ENSMUST00000051212 327 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Pxt1-201ENSMUST00000051526 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Gm26673-201ENSMUST00000181126 3377 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Bod1l-201ENSMUST00000050556 10540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Stpg2-201ENSMUST00000062306 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Kdm4a-204ENSMUST00000106406 4663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Akap1-203ENSMUST00000107904 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Trak2-201ENSMUST00000027186 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Pdzd7-202ENSMUST00000145391 4088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Tmem126b-201ENSMUST00000032843 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Gm11426-201ENSMUST00000125600 2220 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 AC122293.1-201ENSMUST00000218333 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Kif2b-201ENSMUST00000061019 2244 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Speer4b-201ENSMUST00000053257 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Supt20-201ENSMUST00000029315 2112 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Ywhag-201ENSMUST00000055808 3520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Olfr463-202ENSMUST00000215150 2031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 AC164099.2-201ENSMUST00000227795 2005 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Qrfpr-201ENSMUST00000091227 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Palm2-201ENSMUST00000102904 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Anxa7-207ENSMUST00000224975 2727 ntAPPRIS P2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Tfrc-201ENSMUST00000023486 4890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Smg6-201ENSMUST00000045281 5848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Snhg17-203ENSMUST00000141809 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Slc6a12-201ENSMUST00000032200 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Acadsb-202ENSMUST00000117518 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Duxf3-201ENSMUST00000174056 1486 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Oprm1-216ENSMUST00000105611 2420 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Gm29771-201ENSMUST00000193142 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Gm38025-201ENSMUST00000193926 2308 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Fgd4-204ENSMUST00000161188 2214 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Ociad1-202ENSMUST00000071081 1311 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Tada2a-201ENSMUST00000018795 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Gm33914-201ENSMUST00000214108 2150 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Tgfbrap1-201ENSMUST00000095014 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 St5-204ENSMUST00000168005 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Etfrf1-206ENSMUST00000111725 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Hopx-202ENSMUST00000113453 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Gm14740-201ENSMUST00000118538 1150 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Gm15374-201ENSMUST00000119313 844 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Mitd1-205ENSMUST00000139725 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Olfr668-201ENSMUST00000164391 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 1600014C10Rik-203ENSMUST00000177983 403 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 1700003I16Rik-201ENSMUST00000205198 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Rps21-201ENSMUST00000059080 394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Olfr667-201ENSMUST00000071362 981 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Olfr666-201ENSMUST00000081116 957 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Agbl5-201ENSMUST00000069705 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Sall4-203ENSMUST00000103074 3741 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Zdhhc3-208ENSMUST00000147563 6987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 5730403I07Rik-201ENSMUST00000183878 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 Habp2-202ENSMUST00000095948 2815 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Nop58Q6DFW4 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.7 ms