Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Spo11-203ENSMUST00000109126 1625 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm39244-201ENSMUST00000209663 1940 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm45797-201ENSMUST00000212759 1921 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 2310002L09Rik-202ENSMUST00000095023 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm20796-201ENSMUST00000180355 5838 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Kif1b-203ENSMUST00000060537 10233 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Zfp60-208ENSMUST00000167955 2115 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Vmn2r18-201ENSMUST00000165928 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 C1rb-201ENSMUST00000184647 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Spag6l-201ENSMUST00000023468 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm26797-202ENSMUST00000213132 2562 ntTSL 5 BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Mx1-202ENSMUST00000113768 2695 ntTSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Ascc2-201ENSMUST00000070257 2650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Rangap1-203ENSMUST00000171115 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 4632418H02Rik-201ENSMUST00000217287 2721 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Zmat1-201ENSMUST00000064659 3501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Itgax-201ENSMUST00000033053 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Scml4-201ENSMUST00000063063 4885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.93□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm37806-201ENSMUST00000194524 6387 ntBASIC8.93□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Olfr130-202ENSMUST00000215726 5810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Cxcl12-201ENSMUST00000073043 5627 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Ldb3-205ENSMUST00000090040 4981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Smarcc2-202ENSMUST00000099131 4562 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Kctd7-201ENSMUST00000040616 4291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 1700055D18Rik-202ENSMUST00000186030 3720 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Ampd3-206ENSMUST00000170374 3489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Tmed5-205ENSMUST00000119437 3436 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Nemp2-201ENSMUST00000165859 3396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Exoc7-201ENSMUST00000021147 3337 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Dhdds-209ENSMUST00000144668 3219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Uox-201ENSMUST00000029837 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Pax6-206ENSMUST00000111086 2601 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Lrrn4cl-201ENSMUST00000096257 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 5830473C10Rik-201ENSMUST00000094615 2308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Ly9-203ENSMUST00000111277 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Dgkeos-204ENSMUST00000178493 1902 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Rpl15-202ENSMUST00000080281 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Zfhx3-201ENSMUST00000043896 16433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Zfp85os-202ENSMUST00000143812 1784 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm10754-202ENSMUST00000220233 1633 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Arsg-202ENSMUST00000106696 1508 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Wwtr1-202ENSMUST00000120977 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Vma21-201ENSMUST00000114575 4290 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Mff-209ENSMUST00000160972 1358 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Cd55b-201ENSMUST00000112488 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Olfr1349-204ENSMUST00000207820 1325 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Tcea3-201ENSMUST00000102533 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Rhox2-ps-201ENSMUST00000117421 322 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Dusp13-203ENSMUST00000120956 1070 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm15972-201ENSMUST00000132571 418 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm44805-202ENSMUST00000150569 587 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm22846-201ENSMUST00000157706 270 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Rps13-ps2-201ENSMUST00000182017 453 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 1700031P21Rik-203ENSMUST00000191400 466 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm7940-201ENSMUST00000218195 769 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 AC154222.2-201ENSMUST00000225848 607 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Ar-201ENSMUST00000052837 10048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Ralgps2-203ENSMUST00000171292 3346 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Zbtb8b-201ENSMUST00000053042 3288 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Adgra1-201ENSMUST00000026548 4758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Cux1-207ENSMUST00000176216 2821 ntTSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Svs1-201ENSMUST00000037696 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Il20rb-201ENSMUST00000098458 2793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Helz-202ENSMUST00000100305 5953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Carmil2-203ENSMUST00000213019 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 3830406C13Rik-209ENSMUST00000224389 2444 ntAPPRIS P1 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Wnk1-224ENSMUST00000203030 8163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Limch1-202ENSMUST00000101164 5192 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm7967-202ENSMUST00000191042 5042 ntBASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Olfr288-202ENSMUST00000165379 2083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Slc13a4-201ENSMUST00000031868 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Kif2a-202ENSMUST00000117423 2023 ntTSL 5 BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Slc24a5-201ENSMUST00000070353 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.92□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Abcf3-201ENSMUST00000003319 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Mrpl32-202ENSMUST00000220621 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Galnt16-201ENSMUST00000021558 3922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm45170-201ENSMUST00000206746 1671 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm44597-202ENSMUST00000203287 3516 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Pla2g4e-201ENSMUST00000090071 4477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm10874-201ENSMUST00000100526 2355 ntTSL 2 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Dnmt1-202ENSMUST00000177754 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Atg4b-201ENSMUST00000027502 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Celsr3-201ENSMUST00000024238 11547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Mmp9-201ENSMUST00000017881 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Capn3-202ENSMUST00000028749 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Gm42879-201ENSMUST00000198656 2214 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Slc7a14-202ENSMUST00000108245 3080 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Tbx4-202ENSMUST00000108045 2959 ntTSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.91□□□□□ -0.98
Sft2d1Q5SSN7 Mir1247-201ENSMUST00000116706 82 ntBASIC8.91□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms