Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0L1

Zbed3, Zinc finger BED domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 228 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed3Q9D0L1 Slc38a4-202ENSMUST00000166223 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Vmn1r45-201ENSMUST00000054202 3341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Nrd1-203ENSMUST00000106644 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Ing1-206ENSMUST00000210740 1866 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Olfr279-202ENSMUST00000205772 5330 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Kng2-203ENSMUST00000115349 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm6560-201ENSMUST00000198588 1591 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Slc20a1-202ENSMUST00000110315 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm21136-201ENSMUST00000186812 2575 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm6605-201ENSMUST00000031488 2574 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Sh3gl2-202ENSMUST00000107184 671 ntTSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Krt40-202ENSMUST00000107443 1080 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Ptgds-203ENSMUST00000114259 775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm12418-201ENSMUST00000118116 942 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm16441-201ENSMUST00000138176 924 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Fam229b-208ENSMUST00000139743 679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm6038-201ENSMUST00000154310 948 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 9530085P06Rik-201ENSMUST00000182121 827 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm28651-201ENSMUST00000185335 644 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 1700088E04Rik-207ENSMUST00000188562 631 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Mrgprb7-ps-201ENSMUST00000190238 964 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Adh6-ps1-202ENSMUST00000196293 754 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm43610-201ENSMUST00000199117 365 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm43854-201ENSMUST00000200418 394 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Wbp1-209ENSMUST00000205023 716 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 AC152169.1-201ENSMUST00000223901 701 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Olfr456-201ENSMUST00000057251 1052 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Rhox8-201ENSMUST00000071885 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Tmem151a-201ENSMUST00000077066 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Ndrg4-203ENSMUST00000080666 2738 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Pou2f3-201ENSMUST00000034513 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Mier1-205ENSMUST00000106858 4830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Sec13-201ENSMUST00000032440 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Mob1a-201ENSMUST00000038658 4119 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Lpar1-203ENSMUST00000107571 3543 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Me3-202ENSMUST00000032856 4485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 4932438H23Rik-201ENSMUST00000035689 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Mgat1-203ENSMUST00000109194 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Zscan21-201ENSMUST00000062350 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Elavl2-201ENSMUST00000008633 3730 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gfra1-201ENSMUST00000026076 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Oscp1-203ENSMUST00000143712 1473 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gtf2ird2-201ENSMUST00000016086 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Bcl2l11-204ENSMUST00000103211 672 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Zbed3Q9D0L1 Gm8019-201ENSMUST00000119317 587 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Snrnp25-202ENSMUST00000121182 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.68□□□□□ -0.38
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Zbed3Q9D0L1 Mir8111-201ENSMUST00000184463 137 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm38114-201ENSMUST00000191877 1232 ntBASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm19990-201ENSMUST00000219468 1224 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Defb29-201ENSMUST00000060598 462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Vps25-201ENSMUST00000007533 615 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Ss18-202ENSMUST00000040964 4153 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Zfp420-202ENSMUST00000074876 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Csrnp2-201ENSMUST00000061457 4126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Tceanc2-202ENSMUST00000057043 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Sec24d-201ENSMUST00000047923 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Adamts16-202ENSMUST00000109694 3378 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm12530-201ENSMUST00000152074 1759 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Ncor2-205ENSMUST00000111398 8808 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Kcna1-201ENSMUST00000055168 4031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm26686-201ENSMUST00000181951 3467 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Dao-202ENSMUST00000112292 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 2410002F23Rik-204ENSMUST00000107948 2908 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Il1f5-205ENSMUST00000147885 1392 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Dtl-201ENSMUST00000027933 4212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Olfr1495-202ENSMUST00000215930 2025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Sgpp2-201ENSMUST00000036172 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Prph2-201ENSMUST00000024773 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Msl1-202ENSMUST00000037930 1303 ntTSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gm45897-201ENSMUST00000212679 1998 ntTSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Wdr59-202ENSMUST00000038193 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Dsp-201ENSMUST00000124830 9592 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.67□□□□□ -0.38
Zbed3Q9D0L1 Ebf3-202ENSMUST00000106118 3736 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.67□□□□□ -0.38
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