Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKX8

Upk3a, Uroplakin-3a, mousemouse

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Length 287 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upk3aQ9JKX8 Atxn7l1-204ENSMUST00000125192 2644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Trim56-201ENSMUST00000054384 9279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Trim23-203ENSMUST00000069187 3546 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 5530401A14Rik-201ENSMUST00000021044 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Ino80c-204ENSMUST00000153360 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 D830039M14Rik-202ENSMUST00000217740 3362 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Ccdc78-201ENSMUST00000095500 1651 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Scp2-202ENSMUST00000106701 772 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Pfn1-202ENSMUST00000108549 608 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm12389-201ENSMUST00000117696 418 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm12570-201ENSMUST00000122047 1030 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm14665-201ENSMUST00000122294 557 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Smim6-201ENSMUST00000132961 978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm12406-201ENSMUST00000155382 697 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 H1foo-203ENSMUST00000161969 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm20471-201ENSMUST00000172793 626 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm21844-201ENSMUST00000178699 663 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Rpain-201ENSMUST00000018593 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 1700008A23Rik-201ENSMUST00000191694 691 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Ube2d3-216ENSMUST00000199613 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Pet100-203ENSMUST00000207389 363 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 AC159462.1-201ENSMUST00000214822 687 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Myl6-203ENSMUST00000217776 562 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 AC165249.1-202ENSMUST00000217990 734 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm32939-201ENSMUST00000222336 843 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 AC154435.1-201ENSMUST00000223938 959 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 AC134793.1-202ENSMUST00000227444 803 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Smco2-201ENSMUST00000032433 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm7589-201ENSMUST00000085631 534 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Clip1-202ENSMUST00000063905 4589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Grik4-201ENSMUST00000034515 3413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Fanca-202ENSMUST00000118395 3274 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Pip5k1b-202ENSMUST00000112673 2387 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Cap1-201ENSMUST00000069533 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Mcf2l-202ENSMUST00000098927 3215 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Cfap54-201ENSMUST00000020200 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Ccnb1-201ENSMUST00000072119 2489 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Sel1l-210ENSMUST00000178462 6150 ntTSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Igfbp5-201ENSMUST00000027377 6006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm5475-202ENSMUST00000148928 2320 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 9130227L01Rik-202ENSMUST00000189293 1906 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 S100pbp-203ENSMUST00000106059 4084 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Nxpe5-203ENSMUST00000159964 3585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm13264-201ENSMUST00000138416 2011 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Nsl1-202ENSMUST00000078259 4879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Tubb1-201ENSMUST00000016399 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm5532-201ENSMUST00000097531 1751 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm15567-201ENSMUST00000148699 2130 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Tnip1-201ENSMUST00000018482 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Tarm1-203ENSMUST00000203821 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm15987-201ENSMUST00000141700 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm26868-201ENSMUST00000181927 2655 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Arpc3-202ENSMUST00000102525 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Trav13d-1-201ENSMUST00000103588 396 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Ndufs5-203ENSMUST00000106207 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Bri3-202ENSMUST00000110695 669 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Upk3aQ9JKX8 Anxa8-202ENSMUST00000120077 1208 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Upk3aQ9JKX8 Platr20-202ENSMUST00000143209 937 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm11290-203ENSMUST00000147811 314 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 4930405O22Rik-201ENSMUST00000164605 954 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Dpf3-206ENSMUST00000177959 1298 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm26918-201ENSMUST00000182496 728 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Mir8091-201ENSMUST00000183602 139 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm42817-201ENSMUST00000198962 607 ntTSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm7880-201ENSMUST00000203748 871 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Ghrl-204ENSMUST00000203770 891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm33080-201ENSMUST00000205429 172 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Cbx3-ps8-201ENSMUST00000214564 548 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Akr1c18-201ENSMUST00000021635 1200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm9139-201ENSMUST00000218817 700 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 1700011B04Rik-204ENSMUST00000220859 422 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Ndufs5-201ENSMUST00000030401 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Mrps11-201ENSMUST00000032840 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Krtap4-1-201ENSMUST00000081007 1015 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Ifitm2-201ENSMUST00000081649 655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Ppp1r18-201ENSMUST00000113814 3131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Pip5k1a-205ENSMUST00000107233 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Esr2-205ENSMUST00000218621 3342 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Lamc2-203ENSMUST00000185356 4916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Rufy4-202ENSMUST00000127134 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Slc4a9-201ENSMUST00000074298 2714 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Upk3aQ9JKX8 Dis3l-201ENSMUST00000068367 3605 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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