Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0C5

Usp48, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 48, mousemouse

Predictions only

Length 1,052 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Usp48Q3V0C5 Grm5-201ENSMUST00000107263 3516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Atp4a-204ENSMUST00000170371 3447 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp48Q3V0C5 Mb21d1-202ENSMUST00000070742 4049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Clrn1-203ENSMUST00000072551 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Magea2-202ENSMUST00000112559 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Usp48Q3V0C5 Spata13-207ENSMUST00000160973 7467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp48Q3V0C5 Rpap1-202ENSMUST00000099529 4813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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Usp48Q3V0C5 Gm11457-203ENSMUST00000146846 676 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 113.3 ms