Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT54

Obox3, Oocyte-specific homeobox 3, mousemouse

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox3Q3UT54 Fam184b-201ENSMUST00000016023 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Clip1-203ENSMUST00000111561 5883 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 A1cf-202ENSMUST00000224304 2968 ntAPPRIS ALT1 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Lexm-204ENSMUST00000189032 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Pkn3-201ENSMUST00000045246 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Ak8-201ENSMUST00000074156 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Cd276-201ENSMUST00000039788 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Rasal1-201ENSMUST00000031606 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm10646-201ENSMUST00000213227 3293 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Stk17b-201ENSMUST00000027263 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Tro-203ENSMUST00000112709 6610 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm37613-201ENSMUST00000195677 3580 ntBASIC10.21□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Hsd3b6-201ENSMUST00000029463 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Zbtb21-202ENSMUST00000063605 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Rnf40-201ENSMUST00000033088 3906 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Specc1l-201ENSMUST00000040105 5928 ntTSL 5 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Slc6a20b-201ENSMUST00000026273 6307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Pofut1-207ENSMUST00000152390 4833 ntTSL 2 BASIC10.21□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Myh9-201ENSMUST00000016771 7433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.21□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Il27ra-201ENSMUST00000005601 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Rbm8a-203ENSMUST00000198027 2757 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Sept9-203ENSMUST00000100193 2924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Arc-202ENSMUST00000110009 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Arc-201ENSMUST00000023268 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Samhd1-203ENSMUST00000109549 3245 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gaa-201ENSMUST00000026666 3363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Ncdn-201ENSMUST00000030637 3681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Lrrc8b-201ENSMUST00000112707 6726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Egfr-201ENSMUST00000020329 10208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Tmem50a-202ENSMUST00000105863 719 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm11568-201ENSMUST00000107434 1145 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Dab2-203ENSMUST00000110663 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Araf-201ENSMUST00000001155 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Chdh-202ENSMUST00000118917 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm12216-202ENSMUST00000120776 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Katnal2-205ENSMUST00000126153 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Spx-202ENSMUST00000126521 357 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm3625-201ENSMUST00000170816 102 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm26640-201ENSMUST00000180809 3524 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Rbbp5-202ENSMUST00000187505 1977 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 1700088E04Rik-211ENSMUST00000190730 691 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm37651-201ENSMUST00000194679 1494 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 D530033B14Rik-202ENSMUST00000206282 216 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Ptbp3-201ENSMUST00000030076 6855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Cpne9-201ENSMUST00000041203 2777 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm12166-201ENSMUST00000093169 958 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Plcxd2-201ENSMUST00000130481 7140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Zfp354a-204ENSMUST00000109122 4165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Plekhg5-202ENSMUST00000105661 3842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Cep112-213ENSMUST00000150863 3453 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Tacc2-217ENSMUST00000209108 3310 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Krt75-201ENSMUST00000042957 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Fam83a-202ENSMUST00000160942 2876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Cd6-202ENSMUST00000039043 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Rnasel-204ENSMUST00000182538 2761 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Mageb4-202ENSMUST00000113969 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Dzip1l-203ENSMUST00000112885 4350 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Ccdc24-206ENSMUST00000164853 3990 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Mybph-201ENSMUST00000038445 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Dchs1-201ENSMUST00000078482 10754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Slc10a3-204ENSMUST00000114147 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Syncrip-208ENSMUST00000174282 3404 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Ctcfl-202ENSMUST00000179693 3174 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Shc1-210ENSMUST00000191485 3154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Eno3-202ENSMUST00000108548 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Camta2-201ENSMUST00000036299 4495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Rnf216-201ENSMUST00000053498 4474 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Akap3-202ENSMUST00000202574 2879 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 1110051M20Rik-201ENSMUST00000064652 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Arih1-202ENSMUST00000165322 1431 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Adcy8-202ENSMUST00000228014 6900 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Grem1-201ENSMUST00000099575 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Rbm39-201ENSMUST00000029149 2711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Plekhg5-203ENSMUST00000105662 3933 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm3415-201ENSMUST00000110595 924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm3409-201ENSMUST00000110597 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm22711-201ENSMUST00000116890 133 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm8302-201ENSMUST00000119217 852 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Obox3Q3UT54 Gm15968-201ENSMUST00000119342 1168 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.8 ms