Protein–RNA interactions for Protein: A2IDD5

CCDC78, Coiled-coil domain-containing protein 78, humanhuman

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC78A2IDD5 PPP3R1-201ENST00000234310 3023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC78A2IDD5 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC78A2IDD5 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC78A2IDD5 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC78A2IDD5 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC78A2IDD5 ZNRF3-202ENST00000406323 2878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC78A2IDD5 KCNAB2-212ENST00000458166 1336 ntTSL 2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC78A2IDD5 KLK3-216ENST00000617027 1341 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CCDC78A2IDD5 CDYL2-204ENST00000563890 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC78A2IDD5 CDYL2-205ENST00000566173 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC78A2IDD5 AC144522.1-201ENST00000625111 1658 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC78A2IDD5 VTI1B-204ENST00000554659 5351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CCDC78A2IDD5 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC78A2IDD5 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC78A2IDD5 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CCDC78A2IDD5 Z93015.1-201ENST00000451718 390 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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CCDC78A2IDD5 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC78A2IDD5 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.5□□□□□ -0.09
CCDC78A2IDD5 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC14.5□□□□□ -0.09
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CCDC78A2IDD5 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CCDC78A2IDD5 KCNJ9-201ENST00000368088 4170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.09
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CCDC78A2IDD5 TRIM4-201ENST00000349062 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CCDC78A2IDD5 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC78A2IDD5 FAM122B-202ENST00000343004 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC78A2IDD5 STK26-202ENST00000394334 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CCDC78A2IDD5 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.49□□□□□ -0.09
CCDC78A2IDD5 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC14.49□□□□□ -0.09
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CCDC78A2IDD5 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC78A2IDD5 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC78A2IDD5 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CCDC78A2IDD5 LRRC8C-201ENST00000370454 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC78A2IDD5 GNB1L-201ENST00000329517 6706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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CCDC78A2IDD5 PGAP2-201ENST00000278243 2062 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC78A2IDD5 TMUB2-211ENST00000589184 1837 ntTSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC78A2IDD5 TNK1-207ENST00000576812 3023 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC78A2IDD5 SVIL-AS1-204ENST00000427063 2025 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC78A2IDD5 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.48□□□□□ -0.09
CCDC78A2IDD5 DPYSL2-204ENST00000521913 4805 ntTSL 1 (best) BASIC14.48□□□□□ -0.09
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