Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCH7

Cul4a, Cullin-4A, mousemouse

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4aQ3TCH7 Gm12216-207ENSMUST00000220191 1073 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cul4aQ3TCH7 Tnfsf13b-201ENSMUST00000033892 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cul4aQ3TCH7 Olfr553-201ENSMUST00000098222 981 ntAPPRIS P1 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cul4aQ3TCH7 Col19a1-202ENSMUST00000115244 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cul4aQ3TCH7 Ttc7b-206ENSMUST00000223020 3307 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cul4aQ3TCH7 Lig3-210ENSMUST00000173347 3631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cul4aQ3TCH7 Gm28035-201ENSMUST00000139454 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
Cul4aQ3TCH7 Dna2-203ENSMUST00000131422 4122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Trim9-202ENSMUST00000110522 4405 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Myc-206ENSMUST00000167731 1821 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Zfp518b-203ENSMUST00000179555 6816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Vipas39-203ENSMUST00000179379 2418 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Lysmd4-202ENSMUST00000179106 3319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.65□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Tyk2-203ENSMUST00000214454 4770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Ccdc57-201ENSMUST00000056781 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Myo15b-201ENSMUST00000040703 2825 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Kat6b-204ENSMUST00000182405 6977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 AC164092.1-201ENSMUST00000215635 2232 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Gatsl2-201ENSMUST00000016088 7367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Arhgap24-204ENSMUST00000112852 2783 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Spag6-201ENSMUST00000095132 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Csnk1a1-204ENSMUST00000165123 4083 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Tmem88b-201ENSMUST00000097742 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Cdadc1-208ENSMUST00000225839 3189 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Scamp1-203ENSMUST00000152555 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Src-204ENSMUST00000109531 3586 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Rmdn1-202ENSMUST00000108253 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Gm11290-201ENSMUST00000124833 396 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Gm17590-202ENSMUST00000197881 1232 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Gm43458-201ENSMUST00000200791 462 ntTSL 3 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Gm7848-201ENSMUST00000210739 718 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Gm17749-201ENSMUST00000216282 690 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Lcn8-201ENSMUST00000038482 651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 C1qb-201ENSMUST00000046384 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Taar7d-201ENSMUST00000092657 1077 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Rbms3-201ENSMUST00000044901 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Gm43720-201ENSMUST00000159067 6411 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Abi2-205ENSMUST00000187709 1671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Prx-202ENSMUST00000098644 4841 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 B630019A10Rik-201ENSMUST00000149488 2407 ntTSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Plin4-202ENSMUST00000190703 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Ctnnd1-204ENSMUST00000099941 5783 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Cdh20-201ENSMUST00000062528 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Stk4-201ENSMUST00000018353 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Gm6768-201ENSMUST00000022467 1878 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Gpr179-201ENSMUST00000093942 9219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Plscr3-203ENSMUST00000108633 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Nrg1-213ENSMUST00000208617 2787 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Gpr173-201ENSMUST00000070316 4855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Cdk5rap1-201ENSMUST00000028990 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Gm10643-201ENSMUST00000098592 1577 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Csrnp3-208ENSMUST00000176109 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Ehbp1-202ENSMUST00000109563 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Zfp532-202ENSMUST00000169679 5003 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Gm16677-201ENSMUST00000181229 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Gm27174-201ENSMUST00000184493 2174 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Hemk1-201ENSMUST00000035196 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Hist1h3d-201ENSMUST00000105105 1249 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Cyb5d1-202ENSMUST00000108660 1034 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Gm14028-201ENSMUST00000117434 479 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Endov-204ENSMUST00000129327 1184 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 2010001A14Rik-203ENSMUST00000152790 714 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Ppy-201ENSMUST00000017460 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Hcfc1r1-203ENSMUST00000180140 693 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Mir7051-201ENSMUST00000184167 73 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Gm37246-201ENSMUST00000192665 835 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Gm42859-201ENSMUST00000199572 193 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Cox6b1-204ENSMUST00000208838 354 ntTSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 2010001M07Rik-201ENSMUST00000214235 364 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 AC164105.2-201ENSMUST00000215484 524 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 AC164612.1-201ENSMUST00000216699 517 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Erg28-201ENSMUST00000021676 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 AC122024.3-201ENSMUST00000217719 294 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 CT030170.2-201ENSMUST00000223267 126 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Scgb2b2-201ENSMUST00000038835 520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Rpl17-201ENSMUST00000079716 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Frmd4b-201ENSMUST00000032146 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Uhrf1-202ENSMUST00000113035 3402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Cul4aQ3TCH7 Adarb1-204ENSMUST00000105406 6662 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.8 ms