Protein–RNA interactions for Protein: P41164

Etv1, ETS translocation variant 1, mousemouse

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Etv1P41164 Sorbs1-201ENSMUST00000099466 2223 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Fgf1-202ENSMUST00000115582 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Etv1P41164 AC115746.1-201ENSMUST00000228949 3617 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Ccl1-202ENSMUST00000108189 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Avpr2-203ENSMUST00000114395 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Gm13296-201ENSMUST00000117854 997 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Mup-ps29-201ENSMUST00000122281 202 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Gm42867-201ENSMUST00000202995 469 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Gm36503-201ENSMUST00000204284 875 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Isg20-206ENSMUST00000205981 834 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Ccl1-201ENSMUST00000021043 611 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Net1-207ENSMUST00000223258 597 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Etv1P41164 CT485787.1-201ENSMUST00000225617 968 ntBASIC10.01□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Gm16519-201ENSMUST00000092011 489 ntAPPRIS P1 BASIC10.01□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Bora-201ENSMUST00000022656 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Reps1-210ENSMUST00000164556 2537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Ccdc136-208ENSMUST00000180829 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Rnf144b-201ENSMUST00000068891 4640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Cfap61-202ENSMUST00000118002 3230 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Tcf4-203ENSMUST00000114977 3070 ntTSL 1 (best) BASIC10.01□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Stat5a-202ENSMUST00000107356 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Mypn-201ENSMUST00000095580 5246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Ccdc85a-206ENSMUST00000146385 3798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Nfe2l1-203ENSMUST00000107658 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 D130051D11Rik-201ENSMUST00000189171 6188 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Rnf2-201ENSMUST00000076110 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Dcun1d2-202ENSMUST00000110838 2955 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Cd8a-202ENSMUST00000172321 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 C130021I20Rik-201ENSMUST00000147294 3693 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Rnf20-201ENSMUST00000029989 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Hmgcll1-201ENSMUST00000008052 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 AC122382.1-201ENSMUST00000225869 2371 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Gm17767-201ENSMUST00000189410 1470 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Gpr18-201ENSMUST00000055475 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Lasp1-201ENSMUST00000043843 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Slc25a25-202ENSMUST00000052119 3529 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Hmgb2-201ENSMUST00000067925 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Ints6l-201ENSMUST00000039374 3766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Gm23061-201ENSMUST00000102348 116 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Gm12241-201ENSMUST00000118330 726 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Gm8459-201ENSMUST00000162504 760 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Ager-207ENSMUST00000173992 1248 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Gm26782-202ENSMUST00000181697 971 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Gm38321-201ENSMUST00000195053 235 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 3110031N09Rik-201ENSMUST00000201115 326 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Gm5302-201ENSMUST00000202130 796 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 AC159002.1-201ENSMUST00000226714 924 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Iqcf1-201ENSMUST00000085114 613 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Sqor-202ENSMUST00000110506 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Maml3-202ENSMUST00000121440 8288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Ern2-201ENSMUST00000033153 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Col11a1-201ENSMUST00000092155 7667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Cntrl-201ENSMUST00000028235 2734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Gm5525-201ENSMUST00000190438 1312 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Zfp956-201ENSMUST00000101445 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Nit1-201ENSMUST00000111289 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Kif4-201ENSMUST00000048962 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Gm10848-201ENSMUST00000192361 1811 ntTSL 2 BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Gabrr2-201ENSMUST00000024035 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Sf3b5-201ENSMUST00000105139 3841 ntAPPRIS P1 BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Arid2-201ENSMUST00000096250 8507 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 D030055H07Rik-202ENSMUST00000150953 4325 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Ablim1-212ENSMUST00000111558 3123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Arhgap33-204ENSMUST00000207860 4396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Fos-201ENSMUST00000021674 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 9430065F17Rik-203ENSMUST00000223845 1380 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Rps24-210ENSMUST00000225023 1613 ntAPPRIS P4 BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Lrp12-201ENSMUST00000022916 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 D630029K05Rik-201ENSMUST00000033651 2133 ntTSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Ampd2-201ENSMUST00000078912 3368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Grin2b-202ENSMUST00000111905 7484 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Gm44103-201ENSMUST00000204364 3662 ntBASIC10□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Qrfpr-203ENSMUST00000197447 1690 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Mindy4-201ENSMUST00000053094 4270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Etv1P41164 2310065F04Rik-201ENSMUST00000125538 2724 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Trappc9-202ENSMUST00000089770 4047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Etv1P41164 AC117656.2-201ENSMUST00000224931 2215 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Etv1P41164 4930451G09Rik-201ENSMUST00000090457 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Rrp8-202ENSMUST00000098148 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Cer1-201ENSMUST00000048430 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Tmem184b-205ENSMUST00000228002 3315 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Gm43972-201ENSMUST00000181398 1467 ntBASIC9.99□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Il1rap-202ENSMUST00000096129 4438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Mei4-203ENSMUST00000189832 2578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Zc3hav1-201ENSMUST00000031850 3400 ntTSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Arfgef3-201ENSMUST00000019999 5606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Trim6-206ENSMUST00000214578 1506 ntTSL 5 BASIC9.99□□□□□ -0.81
Etv1P41164 Cstf1-201ENSMUST00000116375 3451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.99□□□□□ -0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms