Protein–RNA interactions for Protein: P59240

Nphp4, Nephrocystin-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nphp4P59240 AC164883.7-201ENSMUST00000228534 851 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Pla2g1b-201ENSMUST00000031495 557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Tcf12-201ENSMUST00000034755 4621 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Gm12829-201ENSMUST00000146346 2434 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Gm26912-201ENSMUST00000180988 1483 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Nphp4P59240 Nono-201ENSMUST00000033673 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Ddx55-201ENSMUST00000071057 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Ing1-204ENSMUST00000210041 1881 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Phf24-201ENSMUST00000069184 6392 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Fam53c-201ENSMUST00000049281 4475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Zbtb33-201ENSMUST00000049740 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Ccdc15-206ENSMUST00000217238 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Snph-202ENSMUST00000094456 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Kmt5b-205ENSMUST00000113972 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Myadm-202ENSMUST00000164553 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm24954-201ENSMUST00000178831 110 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm5801-201ENSMUST00000182247 780 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Stx11-202ENSMUST00000163425 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Nit1-203ENSMUST00000111296 1394 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Eya1-201ENSMUST00000027066 4347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 5031425E22Rik-202ENSMUST00000185943 1477 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gpr19-213ENSMUST00000215088 1484 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Ncf1-202ENSMUST00000111275 2721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Lgals8-201ENSMUST00000099820 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Synpo-209ENSMUST00000143275 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Nsd3-210ENSMUST00000153597 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm26584-201ENSMUST00000180551 3216 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Wdr66-202ENSMUST00000121964 4873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Pigb-202ENSMUST00000098566 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm42851-201ENSMUST00000201325 1411 ntBASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Bco1-202ENSMUST00000167370 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 H2-T3-201ENSMUST00000025312 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 BC052040-201ENSMUST00000110918 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Npy1r-201ENSMUST00000039303 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Wdr75-201ENSMUST00000027139 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Acad8-202ENSMUST00000120367 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Hectd2os-203ENSMUST00000142067 2662 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Celf3-213ENSMUST00000199775 2351 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm5159-201ENSMUST00000212733 1652 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Mkrn1-ps1-201ENSMUST00000122035 1390 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Ighv1-50-201ENSMUST00000103521 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Mir291b-201ENSMUST00000104838 79 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm15982-201ENSMUST00000121681 554 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm12606-202ENSMUST00000129527 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm6425-201ENSMUST00000136332 790 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Apobr-203ENSMUST00000137646 457 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm11205-201ENSMUST00000137738 431 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Eef1d-217ENSMUST00000151066 704 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Auts2-216ENSMUST00000185450 144 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Zfp655-203ENSMUST00000196069 1150 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Ywhaq-ps1-201ENSMUST00000206623 710 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm45745-201ENSMUST00000211447 1180 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 AC154585.1-201ENSMUST00000218917 997 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Ttc24-202ENSMUST00000064550 671 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Rbm8a-201ENSMUST00000048915 2608 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 BC030867-201ENSMUST00000100392 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Tmed8-201ENSMUST00000037418 7409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Ano4-202ENSMUST00000181976 1410 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Cblb-203ENSMUST00000226593 3864 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 A530016L24Rik-201ENSMUST00000057465 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Zbtb45-205ENSMUST00000210282 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Rubie-203ENSMUST00000227803 2430 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Ino80dos-201ENSMUST00000138611 1576 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm28624-201ENSMUST00000186430 2131 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Acnat1-201ENSMUST00000095086 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Pja1-201ENSMUST00000036354 2563 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Srd5a3-203ENSMUST00000113507 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm12716-201ENSMUST00000120606 1354 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm13204-201ENSMUST00000120110 821 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Arl14-201ENSMUST00000183126 1200 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm29283-201ENSMUST00000187394 288 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Myo1h-207ENSMUST00000196676 1256 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Lsm3-205ENSMUST00000206947 618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 AC174797.2-201ENSMUST00000225835 165 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Lsm3-201ENSMUST00000040607 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Snap23-203ENSMUST00000116437 2730 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Phka1-203ENSMUST00000113611 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Phka1-205ENSMUST00000120270 6064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Sppl2b-211ENSMUST00000220091 3629 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Gm34425-201ENSMUST00000216269 3079 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Cyp2j13-202ENSMUST00000097973 1648 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Lrrc36-201ENSMUST00000067305 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Daglb-201ENSMUST00000045593 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Nphp4P59240 Cd19-201ENSMUST00000032968 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms