Protein–RNA interactions for Protein: P29033

GJB2, Gap junction beta-2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJB2P29033 ROBO4-201ENST00000306534 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GJB2P29033 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GJB2P29033 MAN2C1-216ENST00000563622 2961 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
GJB2P29033 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GJB2P29033 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
GJB2P29033 LINC01285-204ENST00000634601 1947 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 ACTR10-201ENST00000254286 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 APOBEC3D-202ENST00000427494 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 CETP-201ENST00000200676 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 ACTL7A-201ENST00000333999 1494 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 ANAPC11-202ENST00000357385 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 PGF-202ENST00000405431 666 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AL162426.1-201ENST00000624141 743 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 SLC22A5-201ENST00000245407 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 UROC1-201ENST00000290868 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 GRIK4-208ENST00000638419 3593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 PLEKHD1-201ENST00000322564 4865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 RPS6KA1-213ENST00000526792 2596 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 IFNA6-202ENST00000380210 1544 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 MAP7-204ENST00000454590 3119 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
GJB2P29033 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 ADAM17-204ENST00000618923 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 TUBB8-206ENST00000568584 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AL772337.1-201ENST00000399186 2014 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 TFEB-205ENST00000394283 2595 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 SEC14L3-204ENST00000403066 2474 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 CCL19-201ENST00000311925 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 MDM2-215ENST00000428863 1037 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 CTBP2P5-201ENST00000454986 1264 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AC113192.2-201ENST00000525320 308 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 GCHFR-204ENST00000559445 626 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AC100827.2-201ENST00000563214 1194 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 GNG4-202ENST00000366598 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 MEX3B-202ENST00000558133 4333 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 ALG3-205ENST00000445626 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 KRT17P5-203ENST00000445433 2333 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 UQCC1-204ENST00000374384 2201 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 POU2AF1-201ENST00000393067 3295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 HSPA6-201ENST00000309758 2371 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
GJB2P29033 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 THTPA-201ENST00000288014 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 SNX19-201ENST00000265909 6535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 RRN3P3-202ENST00000551766 3366 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 RPS6KC1-201ENST00000366959 5454 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 SSTR1-201ENST00000267377 4295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
GJB2P29033 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.3 ms