Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2R4

Tmed11, Transmembrane emp24 domain-containing protein 11, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed11Q9D2R4 Gm7841-201ENSMUST00000122108 1629 ntBASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Lrtm2-201ENSMUST00000068351 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Tsc1-204ENSMUST00000113870 7595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Sfi1-202ENSMUST00000081318 3969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 St5-203ENSMUST00000084738 3161 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Ryr1-202ENSMUST00000179893 15358 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Ndrg4-201ENSMUST00000041318 3101 ntTSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Ptcd1-201ENSMUST00000031628 3087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Flg2-201ENSMUST00000098884 7011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Ccdc191-201ENSMUST00000122014 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Cacna1c-209ENSMUST00000187386 6906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Calr-201ENSMUST00000003912 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Vipas39-202ENSMUST00000072744 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Gpi1-201ENSMUST00000038027 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Tardbp-202ENSMUST00000084125 7477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Gm37348-201ENSMUST00000193104 1789 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Nphs1-203ENSMUST00000126297 3877 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Epn2-204ENSMUST00000108713 4207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Dpep2-201ENSMUST00000034373 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Mid1-201ENSMUST00000036753 3753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Cfap43-202ENSMUST00000095998 3764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Dusp16-201ENSMUST00000100857 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Ubap2-202ENSMUST00000108068 4380 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Zfat-204ENSMUST00000162054 4386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Hottip-201ENSMUST00000141300 2346 ntTSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Pigu-205ENSMUST00000165234 1626 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Setmar-201ENSMUST00000049246 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Ttpal-207ENSMUST00000171696 4522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Patz1-207ENSMUST00000134089 1904 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Cstl1-202ENSMUST00000109954 454 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Gm12463-201ENSMUST00000118271 849 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Fhit-201ENSMUST00000160340 1094 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Hsbp1l1-201ENSMUST00000166219 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Malat1-204ENSMUST00000173523 656 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Fhit-208ENSMUST00000179394 453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Gm29054-201ENSMUST00000187589 1185 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Gm37597-201ENSMUST00000191853 382 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 CT571245.2-201ENSMUST00000218421 305 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 AC144543.1-201ENSMUST00000221840 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Mcpt1-201ENSMUST00000022836 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Aurkc-201ENSMUST00000086248 1154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Adamts9-205ENSMUST00000167391 6033 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Bcl2-202ENSMUST00000189999 2841 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Nkx2-2os-201ENSMUST00000136998 4345 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Gm19680-201ENSMUST00000095050 1513 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Tmem184b-202ENSMUST00000178522 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Cd79a-201ENSMUST00000003469 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Lct-201ENSMUST00000073490 6174 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Ccdc40-201ENSMUST00000035935 4979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Lpo-201ENSMUST00000103177 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Ss18l2-206ENSMUST00000215966 2316 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Zzef1-207ENSMUST00000172220 11249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Zc3h18-202ENSMUST00000093073 3705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Gm43154-214ENSMUST00000211225 1420 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 AC160340.2-201ENSMUST00000220812 3675 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Zc3hav1-202ENSMUST00000114898 3052 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Ribc2-201ENSMUST00000023067 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Ppm1f-201ENSMUST00000027373 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Rasal1-205ENSMUST00000156722 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Ints3-201ENSMUST00000029542 4337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Dpf2-202ENSMUST00000118623 2406 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Tspear-201ENSMUST00000092366 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Lrrc61-201ENSMUST00000101436 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Pcdh15-207ENSMUST00000124046 5336 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Pax6-204ENSMUST00000111083 2370 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Pabpc1l-201ENSMUST00000067715 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Mmp21-202ENSMUST00000122136 1599 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Ankrd55-202ENSMUST00000056047 1556 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Plxdc2-201ENSMUST00000028081 6947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Clip3-201ENSMUST00000014065 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Usp45-201ENSMUST00000040429 5861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Pax5-204ENSMUST00000107826 1228 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Chchd7-202ENSMUST00000108386 524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Cspp1-202ENSMUST00000117415 1272 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Chchd7-206ENSMUST00000121110 381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Magohb-205ENSMUST00000173837 897 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Tmem52-204ENSMUST00000178188 908 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Tmem52-205ENSMUST00000178238 968 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Gm43050-201ENSMUST00000201062 338 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Gm32633-201ENSMUST00000205726 587 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Gm7293-201ENSMUST00000216682 1007 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Tmed11Q9D2R4 Gm17383-201ENSMUST00000078739 1041 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.7 ms