Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Gm13326-201ENSMUST00000118730 1011 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf17Q99MV7 Thegl-203ENSMUST00000118941 746 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf17Q99MV7 Gm16552-201ENSMUST00000162348 685 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf17Q99MV7 Gm22876-201ENSMUST00000175450 298 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf17Q99MV7 Gm26698-201ENSMUST00000181290 971 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf17Q99MV7 Gm28391-201ENSMUST00000185202 379 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf17Q99MV7 Gm29528-201ENSMUST00000186699 379 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf17Q99MV7 Gm29526-201ENSMUST00000187217 379 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf17Q99MV7 Gm28746-201ENSMUST00000187453 380 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf17Q99MV7 AC113291.2-201ENSMUST00000215490 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf17Q99MV7 Taar1-201ENSMUST00000051532 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf17Q99MV7 Olfr225-201ENSMUST00000055276 1260 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf17Q99MV7 Atp9b-213ENSMUST00000225980 5150 ntAPPRIS P2 BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf17Q99MV7 2610011E03Rik-201ENSMUST00000200128 2235 ntBASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf17Q99MV7 Ccr6-202ENSMUST00000164411 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Rnf17Q99MV7 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Kalrn-210ENSMUST00000114964 2693 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Fam78b-202ENSMUST00000126198 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Gm16907-201ENSMUST00000180734 2317 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Ctss-201ENSMUST00000015667 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Zfp932-203ENSMUST00000112540 2081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Slc37a4-201ENSMUST00000165839 2086 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Zfp664-201ENSMUST00000111417 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Sugp2-214ENSMUST00000164403 4099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Drd1-201ENSMUST00000021932 3526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Mir704-201ENSMUST00000102106 77 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Lypla1-202ENSMUST00000115529 930 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Ube2l3-203ENSMUST00000115700 571 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Gm13792-201ENSMUST00000121350 423 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Gm20629-201ENSMUST00000176157 513 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Gm6008-201ENSMUST00000206542 874 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Gm44716-201ENSMUST00000209007 710 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Gm6426-201ENSMUST00000209048 854 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Magoh-201ENSMUST00000030348 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Nacc1-201ENSMUST00000001975 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Slc17a8-202ENSMUST00000105295 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Ccdc65-201ENSMUST00000003444 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Gatad2a-206ENSMUST00000212478 3622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Morf4l2-215ENSMUST00000169418 1782 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Zfand4-210ENSMUST00000223495 1751 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Tab1-201ENSMUST00000023050 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Dctn1-205ENSMUST00000113919 4292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Ppp1r2-ps4-201ENSMUST00000112182 633 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Pex13-ps-201ENSMUST00000118184 1157 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Plxna4os3-201ENSMUST00000127668 269 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Gzmn-201ENSMUST00000015587 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Gm23899-201ENSMUST00000158112 90 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 D330041H03Rik-202ENSMUST00000180390 411 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Gm27149-201ENSMUST00000184716 1266 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Gm18182-201ENSMUST00000191380 1251 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Gm37819-201ENSMUST00000194626 1065 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Bpifa5-201ENSMUST00000028986 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Mak16-201ENSMUST00000033983 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Dcun1d2-206ENSMUST00000203604 2112 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Uros-204ENSMUST00000106146 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Pabpc4-204ENSMUST00000106243 3111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 AC110091.3-201ENSMUST00000213406 1304 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Gm42521-201ENSMUST00000199190 2040 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Gm43622-201ENSMUST00000200140 2019 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Igsf5-201ENSMUST00000000163 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Poc1a-211ENSMUST00000217213 1398 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Gm43931-201ENSMUST00000204817 2870 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Gm45165-201ENSMUST00000207763 1631 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Ppih-205ENSMUST00000106321 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 1700112J05Rik-201ENSMUST00000129353 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Gm15650-201ENSMUST00000135451 770 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Baat-202ENSMUST00000166036 1263 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 D130017N08Rik-201ENSMUST00000180460 510 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 C430039J16Rik-201ENSMUST00000181148 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Gm27200-201ENSMUST00000184626 657 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 1810018F18Rik-201ENSMUST00000188253 277 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Gm8918-201ENSMUST00000190587 1087 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Gm37486-201ENSMUST00000195663 405 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Gm42588-201ENSMUST00000200538 1297 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Smim23-201ENSMUST00000020508 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Tmem238l-203ENSMUST00000211300 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Gm31497-201ENSMUST00000216981 638 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Trip13-201ENSMUST00000022053 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Olfr283-202ENSMUST00000215830 2392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Gm44663-201ENSMUST00000206898 3150 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Pigq-201ENSMUST00000026823 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Sh2b1-206ENSMUST00000205889 3011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Nek1-202ENSMUST00000120689 5478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Lamc2-201ENSMUST00000027753 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Siglec1-202ENSMUST00000110226 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Rnf17Q99MV7 Tpm1-205ENSMUST00000113685 1208 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms