Protein–RNA interactions for Protein: P20293

T, Brachyury protein, mousemouse

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Length 436 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TP20293 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Ikbkb-202ENSMUST00000063401 3977 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Clec4b1-202ENSMUST00000078559 748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Rpl15-201ENSMUST00000079419 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Lhfpl5-201ENSMUST00000080780 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Loxhd1-202ENSMUST00000096547 6595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Gnas-223ENSMUST00000185956 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Gnas-224ENSMUST00000186907 3729 ntTSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Ndufs1-203ENSMUST00000168099 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Gm37333-201ENSMUST00000192904 2251 ntBASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Kcnj9-201ENSMUST00000062387 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Rhbdf2-202ENSMUST00000103029 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.54□□□□□ -0.72
TP20293 Hpgd-201ENSMUST00000034026 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Fcrla-201ENSMUST00000046322 1679 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Auts2-209ENSMUST00000161804 5392 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Rsl24d1-201ENSMUST00000034738 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Mrgpre-201ENSMUST00000054048 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Sult1a1-201ENSMUST00000106371 1370 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Sult1a1-202ENSMUST00000106372 1369 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Gm5703-201ENSMUST00000186658 3973 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Mms19-201ENSMUST00000026168 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Psd2-203ENSMUST00000175734 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Csgalnact1-203ENSMUST00000130214 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Ppp6r3-201ENSMUST00000025846 4841 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 4930432K21Rik-202ENSMUST00000118856 2366 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Rsc1a1-201ENSMUST00000105782 1749 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 6030407O03Rik-201ENSMUST00000189514 2094 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Slc38a3-201ENSMUST00000010208 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Ankrd26-201ENSMUST00000112830 6930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Muc13-201ENSMUST00000023520 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Trpv6-201ENSMUST00000031902 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Ddo-202ENSMUST00000213442 2408 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Cep250-201ENSMUST00000039994 7979 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Mcam-202ENSMUST00000098852 2772 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Fhl1-204ENSMUST00000114772 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Edil3-202ENSMUST00000081769 5317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Mical3-217ENSMUST00000207889 9204 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Scyl2-204ENSMUST00000174252 4817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Ldha-ps2-201ENSMUST00000118722 1057 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Gm4726-201ENSMUST00000135604 736 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Gm6019-201ENSMUST00000148369 736 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Sirt2-208ENSMUST00000155327 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Tmem255b-202ENSMUST00000167505 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Gm7741-201ENSMUST00000181445 989 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Gm5342-201ENSMUST00000181982 1003 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Gm9211-201ENSMUST00000182882 975 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Gm4654-201ENSMUST00000183305 982 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Mir6546-201ENSMUST00000184460 62 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Gm18753-201ENSMUST00000201000 566 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Gm8574-201ENSMUST00000203207 924 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Gm35549-202ENSMUST00000203656 1009 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Gm11938-201ENSMUST00000072306 663 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Hepacam-201ENSMUST00000051839 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Pisd-203ENSMUST00000120591 2491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Pkp4-201ENSMUST00000037903 4378 ntTSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Gm19040-201ENSMUST00000203280 4726 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Tcof1-202ENSMUST00000175934 4595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Gm45828-201ENSMUST00000206938 1836 ntBASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Hyal3-201ENSMUST00000040059 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Tas1r2-202ENSMUST00000166773 2524 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Aldh3a2-201ENSMUST00000066277 2892 ntTSL 2 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Pck2-207ENSMUST00000226519 4625 ntAPPRIS P1 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Tfr2-207ENSMUST00000198866 3072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Nxpe5-204ENSMUST00000161047 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Rdh11-201ENSMUST00000085254 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 4732491K20Rik-201ENSMUST00000181774 3142 ntTSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Slc18a1-201ENSMUST00000037478 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Inf2-201ENSMUST00000101029 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Dusp10-201ENSMUST00000048655 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Rims1-204ENSMUST00000097810 6362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.53□□□□□ -0.72
TP20293 Slc29a3-201ENSMUST00000117513 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TP20293 Gm29295-201ENSMUST00000190004 1371 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TP20293 Tmem138-201ENSMUST00000025568 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TP20293 Slc4a9-202ENSMUST00000115694 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TP20293 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TP20293 Enpp5-201ENSMUST00000024756 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TP20293 Elovl7-201ENSMUST00000022207 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TP20293 Lima1-201ENSMUST00000073691 4215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TP20293 Cc2d1a-201ENSMUST00000040383 3471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TP20293 Olfr1490-202ENSMUST00000213900 5165 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.72
TP20293 Limd1-201ENSMUST00000026269 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.72
TP20293 Camk1d-201ENSMUST00000044009 6962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Tmem176b-202ENSMUST00000164733 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Abi1-204ENSMUST00000114544 2790 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Gm10684-201ENSMUST00000098827 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Gm38115-201ENSMUST00000194317 2413 ntTSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Cstad-201ENSMUST00000102853 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Cdc42se1-204ENSMUST00000107201 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
TP20293 Gm12419-201ENSMUST00000116649 636 ntBASIC10.52□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms