Protein–RNA interactions for Protein: P04202

Tgfb1, Transforming growth factor beta-1, mousemouse

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Length 390 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgfb1P04202 Acsl6-208ENSMUST00000108899 1662 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Nefm-202ENSMUST00000111089 3680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gfm1-201ENSMUST00000077271 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Srsf5-201ENSMUST00000094693 1527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Ckap2-201ENSMUST00000046916 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Dennd4a-201ENSMUST00000038890 8645 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 AC124732.3-201ENSMUST00000221835 1765 ntBASIC10.36□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Plekhm1-201ENSMUST00000041272 5968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm5136-201ENSMUST00000218023 1397 ntAPPRIS P1 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Lgals4-201ENSMUST00000066723 1384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Corin-202ENSMUST00000167460 4639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Tubgcp4-201ENSMUST00000039541 4206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Pde3a-201ENSMUST00000043259 12302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gabra1-201ENSMUST00000020707 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 B230312C02Rik-201ENSMUST00000145549 1703 ntTSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Dpt-201ENSMUST00000027861 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Zfp384-204ENSMUST00000088308 2875 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.36□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Jmjd4-202ENSMUST00000108777 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Ltbp1-202ENSMUST00000112514 4870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Mroh8-202ENSMUST00000143663 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Npas2-201ENSMUST00000056815 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Wars-204ENSMUST00000161154 1824 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Ccdc62-201ENSMUST00000094320 3924 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Map4-206ENSMUST00000169851 3446 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Idua-203ENSMUST00000119212 3022 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm42372-201ENSMUST00000206129 5067 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Sord-201ENSMUST00000110551 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Pigb-206ENSMUST00000184035 3221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm6335-201ENSMUST00000118081 1194 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm15615-201ENSMUST00000118876 198 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm7816-201ENSMUST00000119884 1194 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Csf1-204ENSMUST00000120654 821 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm15542-201ENSMUST00000121585 1194 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 4933416E03Rik-201ENSMUST00000133091 1126 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Nudt6-207ENSMUST00000141438 899 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm28923-201ENSMUST00000187755 322 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 1600010M07Rik-202ENSMUST00000188662 654 ntTSL 2 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 4930479H17Rik-201ENSMUST00000208824 292 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Tepp-207ENSMUST00000212056 613 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm33979-201ENSMUST00000219486 691 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 CT009495.1-201ENSMUST00000224221 862 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Tcf21-201ENSMUST00000049930 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Fpr-rs3-201ENSMUST00000071189 1032 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Tas2r125-201ENSMUST00000076119 937 ntAPPRIS P1 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Lsamp-201ENSMUST00000078873 2951 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm23105-201ENSMUST00000083719 134 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Tbc1d14-210ENSMUST00000140607 4649 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Elavl2-207ENSMUST00000107118 3797 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm46430-201ENSMUST00000220478 1989 ntTSL 3 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Hlcs-201ENSMUST00000099512 4833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Iqgap3-201ENSMUST00000071812 5756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Slc13a5-202ENSMUST00000137701 1746 ntTSL 5 BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm18798-201ENSMUST00000187264 1700 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Uba1y-ps1-201ENSMUST00000188314 1708 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm37165-201ENSMUST00000193815 1463 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gfra2-201ENSMUST00000022699 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Mpv17l-204ENSMUST00000141971 2155 ntTSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 D130019J16Rik-201ENSMUST00000193261 2158 ntBASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Msh5-201ENSMUST00000007250 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.35□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gnl2-201ENSMUST00000030684 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm6559-201ENSMUST00000204678 1694 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 AC122018.1-201ENSMUST00000217769 1686 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Plpp3-201ENSMUST00000064139 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Slc25a51-202ENSMUST00000116341 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Vstm2a-201ENSMUST00000109645 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm10699-201ENSMUST00000098916 2130 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm10436-202ENSMUST00000220521 1788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 1700010I14Rik-201ENSMUST00000024650 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Psmc2-201ENSMUST00000030769 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Svop-201ENSMUST00000058472 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Kbtbd12-202ENSMUST00000120933 4644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Myo1h-210ENSMUST00000202006 4631 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Pou2f1-206ENSMUST00000111429 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Ccdc96-201ENSMUST00000060100 3585 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Wwp2-204ENSMUST00000212205 2758 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Slc25a36-202ENSMUST00000085206 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 AC169511.2-201ENSMUST00000226674 2063 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Epb41l1-201ENSMUST00000029155 6220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Nudt13-203ENSMUST00000223663 1633 ntAPPRIS P1 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Ift88-201ENSMUST00000122063 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Rims3-202ENSMUST00000106283 6437 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Numa1-201ENSMUST00000084852 7180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gnas-203ENSMUST00000087876 3719 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Urad-201ENSMUST00000100433 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 S100a4-201ENSMUST00000001046 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Hemk1-202ENSMUST00000118051 453 ntTSL 3 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Mup-ps26-201ENSMUST00000121751 202 ntBASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Cfap100-204ENSMUST00000134224 849 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Smim5-202ENSMUST00000142089 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Nr5a1os-201ENSMUST00000146954 926 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Speer4f2-201ENSMUST00000166086 1278 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 Apoe-210ENSMUST00000174710 514 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
Tgfb1P04202 9430065F17Rik-202ENSMUST00000180908 1084 ntTSL 1 (best) BASIC10.34□□□□□ -0.75
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