Protein–RNA interactions for Protein: B1AY40

Ssxb8, MCG1044712, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssxb8B1AY40 1700123L14Rik-201ENSMUST00000090061 1747 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 9530059O14Rik-201ENSMUST00000181107 3978 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Trp53inp2-201ENSMUST00000043237 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Prdm1-202ENSMUST00000105490 4025 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Zeb1-201ENSMUST00000025081 5805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Trim25-201ENSMUST00000000284 5566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Kansl1-201ENSMUST00000018556 5061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Pak7-201ENSMUST00000035264 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Pou6f1-204ENSMUST00000176271 4575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Trgv2-201ENSMUST00000103563 491 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Ssty2-201ENSMUST00000179136 684 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Ssty2-202ENSMUST00000190565 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm8615-202ENSMUST00000201946 737 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Saa2-202ENSMUST00000210272 511 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 AC118639.2-201ENSMUST00000226289 223 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Krtap19-5-201ENSMUST00000053460 483 ntAPPRIS P1 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Uqcc1-201ENSMUST00000006036 808 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Galm-201ENSMUST00000039205 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Rtn4ip1-202ENSMUST00000105492 2059 ntTSL 3 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Catsper1-201ENSMUST00000043380 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Pfkfb3-202ENSMUST00000049849 2076 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Morf4l2-212ENSMUST00000164609 1811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Ttll7-205ENSMUST00000170055 6075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Mcf2l-222ENSMUST00000173099 6081 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Rasgrp4-213ENSMUST00000204845 3182 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Rabl2-202ENSMUST00000094056 1322 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Klhl7-201ENSMUST00000030841 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 1810014B01Rik-202ENSMUST00000218095 1622 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Rnft2-201ENSMUST00000117177 4381 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Mkl1-204ENSMUST00000134469 4392 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Plekhb1-205ENSMUST00000107046 2793 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Msh3-202ENSMUST00000185852 3946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Smarca2-216ENSMUST00000176769 5703 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Olfr707-205ENSMUST00000214112 1735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Zfp280d-211ENSMUST00000184036 3459 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Zfp617-201ENSMUST00000119003 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm29895-201ENSMUST00000209933 5652 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 AC124433.1-202ENSMUST00000224762 1535 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Alas1-202ENSMUST00000112524 3089 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Eya2-201ENSMUST00000063433 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm42427-201ENSMUST00000200473 5292 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Fbxl18-202ENSMUST00000110766 7857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Dlgap1-214ENSMUST00000155016 4712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Nudt1-205ENSMUST00000110827 744 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm13916-201ENSMUST00000117368 628 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm12196-201ENSMUST00000120954 262 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm15329-201ENSMUST00000121408 155 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 1810063I02Rik-201ENSMUST00000130205 274 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 D630008O14Rik-202ENSMUST00000149909 1043 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Ubl5-206ENSMUST00000161486 794 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Tmcc1-205ENSMUST00000173031 1024 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm37301-201ENSMUST00000195412 568 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm19605-201ENSMUST00000220603 686 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 AC133602.1-201ENSMUST00000227510 509 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Col9a1-201ENSMUST00000054588 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Kcnn3-201ENSMUST00000000811 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm45161-201ENSMUST00000207316 2263 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Ywhaz-201ENSMUST00000022894 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Zfp217-201ENSMUST00000063710 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Ncapd3-205ENSMUST00000216677 5149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gpsm1-201ENSMUST00000066889 3432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Adgrl3-215ENSMUST00000120673 5178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Col5a2-201ENSMUST00000086430 6625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Ciita-201ENSMUST00000023147 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Pcdhb2-201ENSMUST00000056522 2813 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Abhd6-201ENSMUST00000026313 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Syt15-201ENSMUST00000035351 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Adamts9-201ENSMUST00000113438 8016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Axin2-202ENSMUST00000106711 2551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Metap1-203ENSMUST00000197531 3708 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Thbd-201ENSMUST00000099270 3723 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Kyat1-201ENSMUST00000044038 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Bcl9l-203ENSMUST00000218183 6771 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Xlr4c-201ENSMUST00000068551 1500 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gpr68-201ENSMUST00000053668 3099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 C2cd5-201ENSMUST00000087485 4265 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 4933408B17Rik-201ENSMUST00000056932 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Mical1-203ENSMUST00000119962 3565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Ikbkb-201ENSMUST00000033939 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Zfp110-201ENSMUST00000004614 3591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm37368-201ENSMUST00000193173 3212 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Olfr1349-206ENSMUST00000213656 4492 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Fam53a-203ENSMUST00000065162 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 C230024C17Rik-201ENSMUST00000190663 3337 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Asb1-201ENSMUST00000027538 5826 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Cd2bp2-203ENSMUST00000205316 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Dclk1-204ENSMUST00000196745 7962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Pafah1b3-202ENSMUST00000108410 689 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Cetn2-203ENSMUST00000114551 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Zar1l-201ENSMUST00000118769 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm12715-201ENSMUST00000121430 1128 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ssxb8B1AY40 Gm15549-201ENSMUST00000121595 622 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms