Protein–RNA interactions for Protein: W4VSN7

Gm3550, 60S ribosomal protein L29, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3550W4VSN7 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Gm3550W4VSN7 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Gm3550W4VSN7 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms