Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z140

Cpne6, Copine-6, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne6Q9Z140 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
Cpne6Q9Z140 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne6Q9Z140 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne6Q9Z140 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne6Q9Z140 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne6Q9Z140 Sox2-201ENSMUST00000099151 2057 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne6Q9Z140 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne6Q9Z140 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne6Q9Z140 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne6Q9Z140 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne6Q9Z140 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne6Q9Z140 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne6Q9Z140 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cpne6Q9Z140 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne6Q9Z140 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne6Q9Z140 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne6Q9Z140 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne6Q9Z140 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne6Q9Z140 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne6Q9Z140 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne6Q9Z140 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cpne6Q9Z140 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cpne6Q9Z140 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cpne6Q9Z140 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cpne6Q9Z140 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cpne6Q9Z140 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Cpne6Q9Z140 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms