Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULT6

ZNRF3, E3 ubiquitin-protein ligase ZNRF3, humanhuman

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNRF3Q9ULT6 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC27.55■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC27.54■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.53■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.51■■■□□ 2
ZNRF3Q9ULT6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
ZNRF3Q9ULT6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
ZNRF3Q9ULT6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.9 ms