Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Kcnip3Q9QXT8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Kcnip3Q9QXT8 Mtfr1l-201ENSMUST00000102550 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms