Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXD8

Limd1, LIM domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 668 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Limd1Q9QXD8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Limd1Q9QXD8 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Limd1Q9QXD8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Limd1Q9QXD8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms