Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 LINC01970-201ENST00000581489 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.76
LMBRD1Q9NUN5 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMBRD1Q9NUN5 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMBRD1Q9NUN5 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12 ms