Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Ap3m1Q9JKC8 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 2310022A10Rik-205ENSMUST00000187960 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Ap3m1Q9JKC8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Ap3m1Q9JKC8 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms