Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ94

Ssna1, Sjoegren syndrome nuclear autoantigen 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssna1Q9JJ94 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssna1Q9JJ94 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssna1Q9JJ94 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssna1Q9JJ94 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Ssna1Q9JJ94 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssna1Q9JJ94 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssna1Q9JJ94 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssna1Q9JJ94 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssna1Q9JJ94 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Ssna1Q9JJ94 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssna1Q9JJ94 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssna1Q9JJ94 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssna1Q9JJ94 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssna1Q9JJ94 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssna1Q9JJ94 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssna1Q9JJ94 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssna1Q9JJ94 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Ssna1Q9JJ94 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Arl4c-203ENSMUST00000187810 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Ssna1Q9JJ94 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Ssna1Q9JJ94 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.2 ms