Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET37

Slc5a4a, Solute carrier family 5 member 4A, mousemouse

Predictions only

Length 656 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4aQ9ET37 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc5a4aQ9ET37 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc5a4aQ9ET37 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc5a4aQ9ET37 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc5a4aQ9ET37 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc5a4aQ9ET37 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc5a4aQ9ET37 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc5a4aQ9ET37 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc5a4aQ9ET37 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc5a4aQ9ET37 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc5a4aQ9ET37 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Slc5a4aQ9ET37 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Snx21-204ENSMUST00000172577 1825 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Slc5a4aQ9ET37 Tmem80-208ENSMUST00000145184 1805 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Slc5a4aQ9ET37 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms