Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERK0

Ripk4, Receptor-interacting serine/threonine-protein kinase 4, mousemouse

Predictions only

Length 786 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ripk4Q9ERK0 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Csf2ra-201ENSMUST00000076046 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ripk4Q9ERK0 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Wipi1-202ENSMUST00000103060 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Ssbp1-205ENSMUST00000121360 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 9230116N13Rik-201ENSMUST00000181746 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Ripk4Q9ERK0 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ripk4Q9ERK0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms