Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERF3

Wdr61, WD repeat-containing protein 61, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr61Q9ERF3 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr61Q9ERF3 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr61Q9ERF3 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr61Q9ERF3 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr61Q9ERF3 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr61Q9ERF3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr61Q9ERF3 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr61Q9ERF3 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr61Q9ERF3 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Wdr61Q9ERF3 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr61Q9ERF3 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr61Q9ERF3 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr61Q9ERF3 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr61Q9ERF3 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr61Q9ERF3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr61Q9ERF3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr61Q9ERF3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr61Q9ERF3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr61Q9ERF3 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr61Q9ERF3 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr61Q9ERF3 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr61Q9ERF3 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr61Q9ERF3 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr61Q9ERF3 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Wdr61Q9ERF3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Wdr61Q9ERF3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Wdr61Q9ERF3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Wdr61Q9ERF3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Wdr61Q9ERF3 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Wdr61Q9ERF3 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms