Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc38a3Q9DCP2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc38a3Q9DCP2 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc38a3Q9DCP2 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc38a3Q9DCP2 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc38a3Q9DCP2 Fam96b-201ENSMUST00000093234 639 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc38a3Q9DCP2 Pithd1-201ENSMUST00000105851 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc38a3Q9DCP2 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc38a3Q9DCP2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc38a3Q9DCP2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Slc38a3Q9DCP2 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 March8-204ENSMUST00000123405 2102 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Slc38a3Q9DCP2 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc38a3Q9DCP2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc38a3Q9DCP2 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc38a3Q9DCP2 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc38a3Q9DCP2 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc38a3Q9DCP2 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc38a3Q9DCP2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc38a3Q9DCP2 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc38a3Q9DCP2 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc38a3Q9DCP2 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc38a3Q9DCP2 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc38a3Q9DCP2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc38a3Q9DCP2 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Slc38a3Q9DCP2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc38a3Q9DCP2 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc38a3Q9DCP2 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc38a3Q9DCP2 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc38a3Q9DCP2 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc38a3Q9DCP2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc38a3Q9DCP2 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Slc38a3Q9DCP2 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.1 ms