Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB50

Ap1s2, AP-1 complex subunit sigma-2, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap1s2Q9DB50 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ap1s2Q9DB50 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ap1s2Q9DB50 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17 ms