Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7S9

Chmp5, Charged multivesicular body protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp5Q9D7S9 Cnpy3-201ENSMUST00000059844 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Chmp5Q9D7S9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Syt5-201ENSMUST00000065957 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Timmdc1-201ENSMUST00000002925 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Chmp5Q9D7S9 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Rasef-203ENSMUST00000222414 2127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Chmp5Q9D7S9 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Chmp5Q9D7S9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms