Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6F9

Tubb4a, Tubulin beta-4A chain, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb4aQ9D6F9 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tubb4aQ9D6F9 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tubb4aQ9D6F9 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Tubb4aQ9D6F9 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms