Protein–RNA interactions for Protein: Q9D600

Gins2, DNA replication complex GINS protein PSF2, mousemouse

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Length 185 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gins2Q9D600 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gins2Q9D600 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Gins2Q9D600 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gins2Q9D600 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gins2Q9D600 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Gins2Q9D600 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gins2Q9D600 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gins2Q9D600 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Gins2Q9D600 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Gins2Q9D600 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Gins2Q9D600 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms