Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q4

4930578G10Rik, RIKEN cDNA 4930578G10 gene, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930578G10RikQ9D4Q4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
4930578G10RikQ9D4Q4 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.52■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
4930578G10RikQ9D4Q4 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms