Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYI0

Protein Njmu-R1, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CYI0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9CYI0 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9CYI0 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9CYI0 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Q9CYI0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9CYI0 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9CYI0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9CYI0 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9CYI0 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9CYI0 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9CYI0 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Q9CYI0 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9CYI0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9CYI0 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Q9CYI0 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.9 ms