Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

Predictions only

Length 444 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MINDY3Q9CV28 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MINDY3Q9CV28 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MINDY3Q9CV28 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
MINDY3Q9CV28 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
MINDY3Q9CV28 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC19.25■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
MINDY3Q9CV28 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.1 ms