Protein–RNA interactions for Protein: Q9CR41

Hypk, Huntingtin-interacting protein K, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HypkQ9CR41 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
HypkQ9CR41 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Celf6-202ENSMUST00000118164 1583 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC26.22■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.21■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC26.2■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
HypkQ9CR41 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
HypkQ9CR41 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms