Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL2

Ccer1, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccer1Q9CQL2 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ccer1Q9CQL2 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Zcchc24-201ENSMUST00000069180 4556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Rnf8-201ENSMUST00000024817 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ccer1Q9CQL2 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccer1Q9CQL2 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms