Protein–RNA interactions for Protein: Q99P72

Rtn4, Reticulon-4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtn4Q99P72 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Kctd8-202ENSMUST00000087231 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Dus1l-209ENSMUST00000167023 1909 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Dus1l-201ENSMUST00000026151 1930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Rtn4Q99P72 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Rpl7-201ENSMUST00000058437 1163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Bdh1-201ENSMUST00000089759 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 AC153937.1-201ENSMUST00000218734 412 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Rtn4Q99P72 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Rtn4Q99P72 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms