Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Prmt9-201ENSMUST00000056237 2781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 AC164883.3-201ENSMUST00000227396 1774 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Rab28-201ENSMUST00000031011 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Rnf187-201ENSMUST00000094151 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Nmd3Q99L48 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Nmd3Q99L48 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms