Protein–RNA interactions for Protein: Q96CV9

OPTN, Optineurin, humanhuman

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OPTNQ96CV9 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
OPTNQ96CV9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
OPTNQ96CV9 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
OPTNQ96CV9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms