Protein–RNA interactions for Protein: Q969H4

CNKSR1, Connector enhancer of kinase suppressor of ras 1, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNKSR1Q969H4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 YWHAH-202ENST00000397492 1879 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 TSEN54-201ENST00000333213 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
CNKSR1Q969H4 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CNKSR1Q969H4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CNKSR1Q969H4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms