Protein–RNA interactions for Protein: Q92989

CLP1, Polyribonucleotide 5'-hydroxyl-kinase Clp1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLP1Q92989 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 CENPVL3-201ENST00000417339 864 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CLP1Q92989 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CLP1Q92989 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CLP1Q92989 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms