Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 RPP38-207ENST00000616640 1537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 MIR6724-1-201ENST00000616420 92 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
SEMA4DQ92854 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SEMA4DQ92854 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms