Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Atg4d-201ENSMUST00000065005 5951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.55
SptssbQ925E8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Fem1a-201ENSMUST00000060253 6816 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
SptssbQ925E8 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms