Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Med28Q920D3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Tmem62-201ENSMUST00000067582 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Acsl6-209ENSMUST00000108904 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Setd3-201ENSMUST00000071095 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Med28Q920D3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Fndc5-201ENSMUST00000102600 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Med28Q920D3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms