Protein–RNA interactions for Protein: Q91XV3

Basp1, Brain acid soluble protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Basp1Q91XV3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Basp1Q91XV3 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Basp1Q91XV3 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Basp1Q91XV3 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Basp1Q91XV3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Basp1Q91XV3 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Basp1Q91XV3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Basp1Q91XV3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Basp1Q91XV3 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Basp1Q91XV3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Basp1Q91XV3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Basp1Q91XV3 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Basp1Q91XV3 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Basp1Q91XV3 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Basp1Q91XV3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Basp1Q91XV3 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Basp1Q91XV3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Basp1Q91XV3 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Basp1Q91XV3 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Basp1Q91XV3 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Basp1Q91XV3 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Basp1Q91XV3 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Basp1Q91XV3 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Basp1Q91XV3 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Basp1Q91XV3 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Basp1Q91XV3 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Basp1Q91XV3 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Basp1Q91XV3 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Basp1Q91XV3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Basp1Q91XV3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Basp1Q91XV3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Basp1Q91XV3 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Basp1Q91XV3 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms